根据河南省三门峡市社保缴费政策，社保基数为5000元时，每月扣除金额如下：

一、社保缴费明细

1. 社会养老保险

   • 单位缴纳比例：20%

   • 个人缴纳比例：8%

   • 个人月缴金额：5000元 × 8% = 400元

2. 医疗保险

   • 单位缴纳比例：8%

   • 个人缴纳比例：2% + 3元（门诊统筹）

   • 个人月缴金额：5000元 × （2% + 3元/10000元） = 41元

3. 失业保险

   • 单位缴纳比例：0.8%

   • 个人缴纳比例：1%

   • 个人月缴金额：5000元 × 1% = 5元

4. 工伤保险与生育保险

   • 全部由单位缴纳，个人无需缴费

5. 住房公积金

   • 缴纳比例通常为12%（具体比例由单位自主确定）

   • 个人月缴金额：5000元 × 12% = 600元

二、合计月缴金额

• 社保及公积金总金额 ：400元（养老） + 41元（医疗） + 5元（失业） + 600元（公积金） = 1046元

三、注意事项

1. 以上计算基于个人缴费部分，单位缴费部分不计入个人月缴金额；

2. 具体公积金比例可能因单位政策略有差异，建议以实际单位通知为准；

3. 若存在专项附加扣除（如子女教育、住房贷款等），可进一步减少月缴金额。

以上信息综合了河南省社保政策及三门峡市实际执行情况。