在山东淄博，社保基数为5000元的情况下，个人所得税的扣税金额主要取决于多项扣除项和税率，具体计算如下：

1. 1.社保及公积金扣除：养老保险：个人缴纳比例为8%，即5000元×8%=400元。医疗保险：个人缴纳比例为2%，即5000元×2%=100元。失业保险：个人缴纳比例为0.3%，即5000元×0.3%=15元。住房公积金：假设缴纳比例为12%，即5000元×12%=600元。总计扣除：400元+100元+15元+600元=1115元。
2. 2.应纳税所得额计算：起征点：根据现行税法，个人所得税起征点为5000元。应纳税所得额：社保基数5000元-社保及公积金扣除1115元-起征点5000元=-1115元。由于应纳税所得额为负数，因此无需缴纳个人所得税。
3. 3.税率及速算扣除数：根据现行税率表，应纳税所得额不超过3000元的部分，税率为3%，速算扣除数为0。由于在上述计算中，应纳税所得额为负数，因此不适用此税率表。
4. 4.特殊情况说明：如果社保基数或缴纳比例有所调整，应纳税所得额也会相应变化。某些地区可能存在额外的税收优惠政策或补贴，这也会影响最终的个人所得税金额。
5. 5.在山东淄博，社保基数为5000元的情况下，由于各项社保及公积金扣除后，应纳税所得额为负数，因此无需缴纳个人所得税。了解社保基数和税率的变化对于合理规划个人财务至关重要，建议定期关注相关政策更新。

通过以上分析，可以看出在山东淄博，社保基数为5000元时，个人所得税的扣税金额为0元。这一结果适用于大多数普通工薪阶层，具体情况还需根据个人实际情况和当地政策进行详细计算。