福建宁德社保基数为5900时，个人所得税的扣税情况如下：

1. 1.社保缴纳情况：社保基数5900元意味着个人每月需要缴纳的社保费用是按照5900元的基数来计算的。社保通常包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险等。具体的缴纳比例因地区和单位而异，一般情况下，个人需要承担的比例大约为10.5%左右。5900元的社保基数，个人每月大约需要缴纳619.5元的社保费用。
2. 2.个人所得税计算：在扣除社保费用后，剩余的收入才是计算个人所得税的基数。假设5900元的社保基数，个人每月缴纳619.5元的社保费用，那么应税收入为5900-619.5=5280.5元。根据中国的个人所得税税率表，5280.5元的应税收入适用3%的税率。计算方法为：5280.5元×3%=158.415元。个人每月需要缴纳的个人所得税约为158.42元（四舍五入到小数点后两位）。
3. 3.综合计算：综合以上计算，5900元的社保基数，个人每月需要缴纳的社保费用约为619.5元，缴纳的个人所得税约为158.42元，总的扣除金额为619.5+158.42=777.92元。最终，个人每月实际到手收入为5900-777.92=5122.08元。
4. 4.其他注意事项：上述计算是基于一般情况下的社保缴纳比例和个人所得税税率，具体情况可能因地区政策、单位福利等因素有所不同。个人所得税的计算还涉及到专项附加扣除等因素，如子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息、住房租金和赡养老人等。如果有这些扣除项目，实际缴纳的个人所得税可能会更低。

福建宁德社保基数为5900元时，个人每月需要缴纳的社保费用约为619.5元，缴纳的个人所得税约为158.42元，最终实际到手收入约为5122.08元。了解这些信息有助于个人更好地规划自己的财务状况。