医保关系转移不会影响社保转移。根据相关法律法规和搜索结果，社保转移和医保转移是两个独立但关联的业务，具体说明如下：

一、业务性质与关联性

1. 社保转移

   指将基本养老保险关系从一个参保地转移到另一个参保地，涉及个人账户余额和缴费年限的累计计算。

2. 医保转移

   需在社保转移完成后单独办理，涉及医疗保险关系的接续，包括个人账户余额和缴费年限的转移。

二、转移流程与办理要求

1. 同时办理

   社保转移和医保转移可以一并办理。在办理社保转移时，需同时提交医保转移申请材料。

2. 办理材料

   需提供原参保地《基本医疗保障参保（合）凭证》、新参保地接收证明等材料。

3. 转移内容

   • 医保转移 ：个人账户余额、缴费月数及医保待遇（如门诊费用报销）将转移至新参保地。

   • 养老保险转移 ：仅转移个人账户余额和统筹账户部分（部分地区可能转移全部）。

三、注意事项

1. 缴费年限累计

   医保缴费年限不累计，但合并后两地医保可按新参保地政策计算待遇。

2. 跨省转移限制

   目前跨省转移仅支持养老保险和医疗保险，其他险种暂不支持。

3. 时间要求

   需在达到法定退休年龄前办理转移，退休后医保待遇将切换至新参保地规定。

四、法律依据

根据《中华人民共和国社会保险法》第十九条和第三十一条规定，基本养老保险关系随人员转移，医疗保险关系需单独转移接续。

医保关系转移是社保转移的必要补充，两者需协同办理以确保待遇连续性。