根据江苏扬州的社保基数12500元，扣除社保后的个税计算如下：

一、扣除社保后的应纳税所得额

江苏个税起征点为5000元，社保缴费基数为12500元时： $$\text{应纳税所得额} = 12500 - 12500 - 3500 = -3500 \text{元}$$

由于应纳税所得额为负数，说明未达到纳税标准，无需缴纳个税。

二、若未扣除社保的个税计算

若12500元为未扣除社保的工资： $$\text{应纳税所得额} = 12500 - 3500 = 9000 \text{元}$$

根据2023年最新税率表，适用税率为25%，速算扣除数为2660元： $$\text{应纳税额} = 9000 \times 25% - 2660 = 2250 - 2660 = -410 \text{元}$$

同样，结果为负数，无需缴税。

三、注意事项

1. 社保扣除标准 ：江苏社保缴费基数为12500元时，个人缴纳部分约为829元（养老保险+医疗保险），单位缴纳部分约为3671元；

2. 专项附加扣除 ：若存在子女教育、住房贷款等专项附加扣除，可进一步减少应纳税所得额；

3. 年度汇算清缴 ：若全年综合所得未达纳税标准，但年度汇算时存在可抵扣项目，需办理汇算清缴。

建议通过官方渠道（如江苏税务APP或税务局官网）确认具体纳税情况。