吉林通化社保基数6400元时，扣税金额需根据个人应纳税所得额来计算，具体金额因个人收入情况等因素而异。

以下是具体分析：

一、社保缴纳情况

在计算扣税金额前，先要明确社保的扣除。社保通常包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险等部分。以一般比例为例，养老保险个人缴费比例约为8%，医疗保险个人缴费比例约为2%，失业保险个人缴费比例约为0.5%等（各地具体比例可能有所差异）。

• 假设养老保险按8%的比例缴纳，那么养老保险扣除金额为6400×8% = 512元。
• 假设医疗保险按2%的比例缴纳，那么医疗保险扣除金额为6400×2% = 128元。
• 假设失业保险按0.5%的比例缴纳，那么失业保险扣除金额为6400×0.5% = 32元。

所以，仅社保部分大约扣除金额总计为512 + 128 + 32 = 672元。

二、应纳税所得额计算

应纳税所得额 = 工资收入 - 社保扣除金额 - 起征点（目前起征点为每月5000元）

• 已知社保扣除约672元，那么应纳税所得额 = 6400 - 672 - 5000 = 728元。

三、个人所得税计算

根据我国个人所得税税率表，应纳税所得额不超过36000元的部分，适用3%的税率（快速计算时采用此税率）。

• 则扣税金额 = 应纳税所得额×税率 = 728×3% = 21.84元。

当吉林通化社保基数为6400元时，大约扣税21.84元。但需要注意的是，实际扣税金额可能会因个人的具体情况以及当地相关政策的细微差异而有所不同。