山西临汾社保缴费基数9900元和5000元的主要区别体现在适用范围和缴费比例上，具体分析如下：

一、缴费基数适用范围

1. 9900元缴费基数

   适用于单位缴费基数上限的情况，单位缴费比例固定为20%，个人缴费比例8%。该基数高于当地最低档1980元/月，但低于最高档3300元/月。

2. 5000元缴费基数

   适用于单位缴费基数下限的情况，单位缴费比例同样为20%，个人缴费比例8%。该基数为当地最低档，保障基本社保权益。

二、缴费比例差异

• 养老保险 ：

  • 9900元：单位20%，个人8%

  • 5000元：单位20%，个人8%

  比例相同，差异体现在基数档次

• 其他险种 ：

  养老保险、医疗保险、失业保险、生育保险、工伤保险的缴费比例在9900元和5000元基数下均保持一致，例如养老保险单位8%、个人2%等

三、实际影响

1. 养老金计算

   养老金待遇与缴费基数和缴费年限相关。9900元基数对应的养老金可能高于5000元基数，但具体金额还受个人账户积累等因素影响。

2. 缴费金额差异

   月缴费金额 = 基数 × （单位比例 + 个人比例）

   例如：

   • 9900元基数：9900 × （20% + 8%） = 2772元/月

   • 5000元基数：5000 × （20% + 8%） = 1440元/月

   9900元基数下月缴金额更高

四、选择建议

• 单位选择 ：若单位经济效益较好，可选择9900元基数以降低整体缴费成本；若经营压力较大，5000元基数可减轻负担。

• 职工选择 ：5000元基数保障基本权益，9900元基数适合希望提高养老金待遇的职工。

建议职工根据自身经济状况和养老规划，结合单位政策选择合适的缴费基数。