新农合跨区住院报销流程如下：

一、异地就医备案

1. 线上备案

   通过"国家异地就医备案"小程序办理，需提前30天完成备案。

   • 突发情况可在入院后3日内电话报备。

2. 线下备案

   携带身份证、新农合医疗证到参保地县合管办现场办理。

二、选择定点医院

1. 登录"国家医保服务平台"查询跨省联网定点医疗机构，优先选择支持直接结算的医院。

2. 跨省就医需确认医院是否为参保地批准纳入新型农村合作医疗的定点医疗机构。

三、住院登记与费用管理

1. 住院登记

   出院时出示身份证、新农合医疗证办理入院手续，主动告知医院备案信息。

2. 费用清单管理

   要求医院提供每日用药清单、检查项目明细及特殊治疗说明。

四、出院材料准备与报销申请

1. 必备材料

   • 住院发票（原件）

   • 费用总清单

   • 出院小结/诊断证明

   • 身份证、户口本（非本人办理需代办人证明）

2. 补充材料

   • 急诊证明（未备案者）

   • 务工单位证明（外务工人员）

3. 报销流程

   • 直接结算 ：开通跨省直结的医院直接抵扣报销部分。

   • 回参合地报销 ：携带材料到县合管办，15个工作日内审核通过后领取报销款。

五、其他注意事项

1. 转诊备案时效 ：3个月内有效，超期需重新申请。

2. 费用报销标准 ：按参保地政策执行，设起付线、封顶线及分段报销比例。

3. 特殊情况处理 ：

   • 疑难病症可提前向参合地申请转诊；

   • 私立定点医院纳入报销范围。

建议办理前通过当地医保部门或官方平台确认最新政策，不同地区可能存在细微差异。