山西晋中社保基数13900和5000存在显著差异，主要体现在缴费金额、待遇享受等方面。

一、缴费金额

1. 养老保险：以2023年为例，若社保缴费基数为13900元，单位缴纳金额约为2739×20%=5478元，个人缴纳金额约为2739×8%=2191元；若社保缴费基数为5000元，单位缴纳金额约为5000×16%=800元，个人缴纳金额约为5000×8%=400元。

2. 医疗保险：社保缴费基数13900元时，单位缴纳金额约为2739×10%=2739元，个人缴纳金额约为2739×2%=548元；社保缴费基数5000元时，单位缴纳金额约为5000×8%=400元，个人缴纳金额约为5000×2%=100元。

3. 失业保险：社保缴费基数13900元时，单位缴纳金额约为2739×1.5%=411元，个人缴纳金额约为2739×0.5%=137元；社保缴费基数5000元时，单位缴纳金额约为5000×1.5%=75元，个人缴纳金额约为5000×0.5%=25元。

4. 工伤保险：社保缴费基数13900元时，单位缴纳金额约为2739×0.2%-1.9%（根据行业风险类别不同而有所不同）；社保缴费基数5000元时，单位缴纳金额约为5000×0.2%-1.9%。

5. 生育保险：社保缴费基数13900元时，单位缴纳金额约为2739×0.8%=220元；社保缴费基数5000元时，单位缴纳金额约为5000×0.8%=40元。

二、待遇享受

1. 养老金：养老金的计算与缴费基数、缴费年限等因素密切相关。缴费基数越高，在相同缴费年限的情况下，退休后领取的养老金数额相对越高。

2. 医疗保险：医保个人账户的划入金额与缴费基数有关，缴费基数越高，划入个人账户的金额相对较多，可用于门诊看病、购药等支出。

山西晋中社保基数13900和5000的差异主要体现在以上方面。这些差异会直接影响到个人的社会保障水平和福利待遇。