山西晋城社保基数为6900时，个人所得税的扣税情况主要取决于多项因素，包括社保缴纳比例、专项扣除以及适用的税率等。根据现行税法，6900元的社保基数在扣除社保费用、免征额以及其他专项扣除后，实际应纳税所得额会显著降低，从而适用较低的税率。

1. 1.社保缴纳比例：在山西晋城，社保缴纳比例通常包括养老保险、医疗保险、失业保险等。养老保险一般由个人缴纳8%，医疗保险为2%，失业保险为0.5%。以6900元为基数，养老保险需缴纳552元，医疗保险需缴纳138元，失业保险需缴纳34.5元，总计724.5元。
2. 2.免征额与专项扣除：根据现行税法，个人所得税的免征额为5000元。还可以享受专项扣除，如子女教育、继续教育、住房贷款利息、住房租金、赡养老人等。假设无其他专项扣除，6900元的社保基数在扣除社保费用724.5元后，剩余6175.5元，再减去免征额5000元，实际应纳税所得额为1175.5元。
3. 3.适用税率与速算扣除数：根据个人所得税税率表，1175.5元的应纳税所得额适用3%的税率，速算扣除数为0。应缴纳的个人所得税为1175.5元×3%=35.27元。
4. 4.综合计算：综合以上计算，6900元的社保基数在扣除社保费用724.5元和免征额5000元后，实际应缴纳的个人所得税为35.27元。最终，个人实际到手收入为6900元-724.5元-35.27元=6140.23元。

总结来说，山西晋城社保基数为6900元时，在扣除社保费用和免征额后，实际应缴纳的个人所得税约为35.27元。了解这些扣税细节，有助于个人更好地规划财务，确保合理纳税。