根据山西太原社保政策及搜索结果，灵活就业人员以9900元为缴费基数退休时的养老金计算如下：

一、基础养老金计算

基础养老金公式为： $$ \text{基础养老金} = \frac{\text{全省上年在岗职工月平均工资} + \text{本人指数化月平均缴费工资}}{2} \times \text{缴费年限} \times 1% $$

1. 缴费基数与计发基数

   • 2023年太原市社保缴费基数上限为平均工资的300%，下限为60%。若以9900元为缴费基数，则对应计发基数为9900元（即缴费基数与计发基数一致）。

   • 假设退休时全省上年在岗职工月平均工资为6897元，则本人指数化月平均缴费工资为9900元。

2. 计算示例

   • 假设缴费年限为30年，则基础养老金为： $$ \frac{6897 + 9900}{2} \times 30 \times 1% = 9847.5 \times 30 \times 0.01 = 2954.25 \text{元} $$

二、个人账户养老金计算

个人账户养老金公式为： $$ \text{个人账户养老金} = \frac{\text{退休时个人账户累计存储额}}{\text{计发月数}} $$

• 假设退休时个人账户累计存储额为86,866.56元，60岁退休对应的计发月数为139个月，则个人账户养老金为： $$ \frac{86,866.56}{139} \approx 624.94 \text{元} $$

三、总养老金计算

总养老金=基础养老金+个人账户养老金 $$ 2954.25 + 624.94 \approx 3579.19 \text{元} $$

四、注意事项

1. 缴费年限与指数

   实际养老金受缴费年限和缴费基数（即指数化月平均缴费工资）影响。若缴费年限更长或缴费基数更高，养老金将相应增加。

2. 计发基数差异

   若退休时全省平均工资上涨，但个人账户累计存储额未同步增长，基础养老金可能低于按新基数计算的结果。

以9900元为缴费基数退休时，总养老金约为3579元，具体金额需根据实际缴费年限和个人账户积累情况确定。