根据2024年最新政策，农村合作医疗在县级医疗机构的报销比例如下：

一、住院报销比例

1. 起付线标准

   县级定点医疗机构的起付线为 500元 ，即医疗费用超过500元部分开始报销。

2. 报销比例分段

   • 500元（不含）-10000元 ：报销 65%

   • 10000元（不含）以上 ：报销 50%

二、其他注意事项

1. 年度补偿封顶线

   各地政策存在差异，但普遍设有 6万元 的年度补偿总金额封顶线。

2. 特殊病种门诊报销

   • 11种特定慢性病（如高血压、糖尿病等）在县级及以上医疗机构就诊可按门诊报销比例（30%-65%）报销，需提供《就诊证》。

3. 地区差异

   具体比例可能因地区政策调整而变化，例如武汉县部分医院二级医院起付线400元、6000元以下报销65%等。建议参保人员咨询当地医保部门获取最新信息。

三、计算示例

若某患者在县级医院住院花费15000元：

• 起付线500元自费，剩余14500元可报销；

• 报销金额 = 14500元 × 65% = 9425元；

• 总自费 = 15000元 - 9425元 = 5575元。

建议参保人员就医前咨询当地医保机构，以确认具体报销细则和比例。