安徽新农合在上海就医的报销政策如下：

一、直接结算与异地就医备案

1. 直接结算条件

   若上海的医疗机构为全国异地就医直接结算定点医疗机构（如复旦大学附属医院等），安徽新农合患者可按就医地医保目录和参保地支付比例直接结算。

2. 备案要求

   • 需提前办理异地就医备案，可通过国家医保平台APP提交转院证明或居住证明（如房产证、居住证等）。

   • 若未备案或备案失败，需回安徽参保地报销。

二、报销比例与限额

1. 报销比例

   • 定点医疗机构 ：普通住院报销比例根据医院级别确定（镇卫生所60%、二级医院40%、三级医院30%）。

   • 非定点医疗机构 ：需回安徽报销，报销比例可能低于本地（约50%）。

2. 报销限额

   每年统筹基金设有报销封顶线，超出部分由个人承担。

三、报销流程

1. 直接结算流程

   • 在上海定点医疗机构住院时，直接使用医保支付，出院后由医保局结算。

2. 回原籍报销流程

   • 保存完整医疗费用发票、诊断书、出院小结等材料，回安徽参保地医保局提交报销申请。

四、特殊情况说明

• 转诊证明 ：部分医院需提前办理转诊证明，出院后转诊证明无效。

• 新农合与职工社保冲突 ：在上海缴纳社保后，安徽新农合是否暂停需确认是否转为居民医保。

总结

安徽新农合在上海就医无法直接使用，需根据就医地政策选择直接结算或回原籍报销。建议提前通过医保平台备案，并了解具体报销比例和材料要求，以减少自费金额。