新农合医疗费用报销流程可分为门诊、住院及特殊病种门诊等不同类型，具体如下：

一、门诊费用报销流程

1. 直接刷卡结算

   参保人员在参保地乡镇级普通门诊定点医疗机构就诊时，持新农合医疗卡和身份证可直接刷卡报销门诊费用，个人自付部分由医院垫付。

2. 慢性病门诊报销

   患有慢性病的参保人员，在二级及以上定点医疗机构门诊就诊时，需提供病历、检查报告及《新型农村合作医疗特殊病种门诊治疗审批表》，经审核后按住院报销标准报销。

二、住院费用报销流程

1. 出院时结算

   住院期间需办理医保登记，出院时向医院提交住院发票、费用清单、出院小结等材料，医院直接扣除医保报销部分。

2. 市外住院报销

   • 需提前办理转诊备案手续（携带身份证、新农合医疗证等）；

   • 出院后3个月内提交医疗费用原始凭证、明细清单等材料至当地新农合窗口。

三、特殊病种门诊报销流程

1. 申请材料

   持二级及以上定点医疗机构出具的病历、检查报告及《新型农村合作医疗特殊病种门诊治疗审批表》；

2. 审核批准

   提交材料至新农合业务管理中心，经审核通过后按年度限额报销门诊费用（不含辅助治疗等特定项目）。

四、其他注意事项

1. 缴费与参保

   • 每年需按时缴纳新农合费用，避免影响报销；

   • 不同地区政策存在差异，需提前了解当地报销比例、起付线等细则。

2. 材料要求

   • 所有材料需真实完整，包括身份证、医疗卡、费用清单、诊断证明等；

   • 市外就医需注意报销时效（通常为出院后3个月内）。

3. 代理申请

   • 无法亲自办理时，可委托配偶、父母、子女或村民委员会负责人代为申请。

以上流程综合了不同地区的通用做法，具体以当地最新政策为准。建议参保人员定期咨询医保部门或乡镇合管所，确保流程合规。