当公司社保减员操作已完成但医保未同步减员时，可按以下步骤处理：

一、联系原单位处理

1. 直接沟通要求减员

   向原单位人事部门提交书面申请，附上离职证明等必要材料，要求立即办理医保减员手续。

2. 保留证据并投诉

   若单位拒绝或拖延，收集沟通记录、邮件等证据，向当地医保部门或劳动监察部门投诉举报。

二、通过社保部门处理

1. 线上办理减员

   登录当地社保服务大厅官网（如北京可通过“北京市社会保险网上服务平台”），在“企业职工社会保险增减员表”中勾选医保减员选项，提交相关证明材料。

2. 线下办理流程

   携带《企业职工社会保险增减员表》《解除/终止劳动合同证明书》到社保服务大厅窗口办理，确保在离职后15个工作日内完成减员登记。

三、注意事项

1. 避免重复参保

   若新单位已尝试增员但未成功，需与原单位协商补缴欠费或转移社保，避免因信息滞后导致新单位无法增员。

2. 费用追缴与补偿

   若因单位过错导致多缴社保，可向税务部门申请退费；若因此产生医疗费用损失，可结合劳动仲裁要求单位赔偿。

3. 时效性要求

   劳动者离职后15日内是办理减员的法定时效，超期可能影响后续维权。

四、法律依据

根据《中华人民共和国劳动合同法》第十七条，用人单位未依法缴纳社保的，劳动者有权解除劳动合同。《社会保险法》规定用人单位需及时办理社会保险变更登记。

建议优先通过社保部门线上渠道办理减员，若遇阻力可结合劳动仲裁等法律途径解决。