公司缴纳社保但不单独缴纳医保是不允许的，因为社保和医保是捆绑的法定义务，企业必须依法为员工缴纳全部险种（含养老、医疗、失业、工伤、生育保险），否则将面临罚款、员工索赔等法律风险，同时员工也无法享受医保待遇。

1. 法律强制性与捆绑关系
   社保体系中的五险（养老、医疗、失业、工伤、生育）是一个整体，企业不能选择性缴纳。根据《社会保险法》，用人单位必须为员工办理全部险种的登记和缴费，单独不缴医保属于违法行为，社保部门可责令补缴并处以欠缴金额1-3倍的罚款。

2. 员工权益受损风险
   若企业不缴医保，员工将无法享受医疗费用报销、生育津贴等待遇，突发疾病或工伤时需自费承担高额医疗支出。医保缴费年限中断会影响退休后终身医保待遇的资格（通常需累计缴满20-25年）。

3. 企业面临的处罚与成本
   除补缴和罚款外，员工可据此解除劳动合同并要求经济补偿（每工作1年补偿1个月工资）。若因缺医保导致员工医疗费用无法报销，企业还需额外赔偿损失，法律纠纷可能进一步影响企业声誉。

总结：企业不可拆分缴纳社保和医保，合规缴费既是法定义务，也是保障员工健康与企业稳定运营的基础。任何选择性缴费的行为都将引发法律和财务风险，务必依法足额缴纳全部险种。