住院医保并非直接扣个人余额，而是通过医保统筹基金和个人账户共同承担费用。住院费用首先由医保统筹基金支付，超出部分再根据不同情况由个人账户或现金支付。以下是详细的解释：

1. 1.医保统筹基金的作用：医保统筹基金是医保制度的核心部分，用于支付参保人在住院期间的大部分医疗费用。参保人住院时，医疗费用会先由统筹基金按照规定的比例进行报销。例如，在三级医院住院，统筹基金通常会报销约60%-70%的费用，具体比例根据当地医保政策有所不同。统筹基金的支付范围包括住院床位费、诊疗费、手术费、药品费等基本医疗费用，但不包括自费项目和非医保范围内的费用。
2. 2.个人账户的使用：个人账户是医保卡中个人缴纳的部分，主要用于支付门诊费用、药店购药以及住院费用中需个人自付的部分。在住院情况下，如果统筹基金支付后仍有剩余费用需要个人承担，这部分费用会优先从个人账户中扣除。例如，如果住院总费用为1万元，统筹基金报销了7000元，剩余的3000元需要个人支付。此时，个人账户中的余额将用于支付这3000元。如果个人账户余额不足，剩余部分则需由个人以现金支付。
3. 3.自费项目和政策差异：除了统筹基金和个人账户支付的部分，还有一些费用属于自费项目，如特需病房费用、进口药品费用等，这些费用需要个人全额承担。不同地区的医保政策可能存在差异，具体报销比例和支付方式需参照当地医保部门的规定。例如，一些地区对重大疾病有额外的报销政策，个人负担相对较轻。
4. 4.报销流程和注意事项：住院医保报销通常在医院结算时直接办理，患者只需支付个人承担的部分。医院会与医保部门结算统筹基金支付的部分。参保人需注意保留好住院期间的医疗费用清单、发票等凭证，以便在报销过程中提供必要的证明材料。

总结来说，住院医保的费用主要由医保统筹基金支付，个人账户在必要时补充支付。了解具体的报销流程和政策，有助于更好地享受医保待遇，减轻个人经济负担。参保人应密切关注当地医保政策的变化，以便及时调整自己的医疗支出计划。