个人缴纳医保的总费用通常高于单位缴纳，因为单位会承担大部分缴费比例（如单位缴6%-10%，个人仅缴2%），而灵活就业者需全额自付（约8%-10%）。但具体金额差异取决于缴费基数、地区政策及年龄等因素。
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缴费比例差异
单位参保时，医保费用由单位和个人共同承担，单位缴费比例一般为6%-10%（含生育保险），个人仅需缴纳2%。例如月薪1万元，单位缴600-1000元，个人缴200元。而灵活就业者需全额缴纳，比例通常为3.4%-4.4%（35岁为分界）或8%-10%，按相同基数计算，个人需支付800-1000元，明显高于职工自付部分。 -
缴费基数影响
单位缴费基数按职工工资确定（上下限为当地平均工资的60%-300%），而灵活就业者通常按全省平均工资缴费。若个人工资低于平均工资，单位参保可能更划算；若工资较高，灵活就业者可能因基数固定而负担更重。 -
附加成本与待遇
单位参保包含五险（养老、医疗、失业等），个人仅能缴纳医保和养老，且灵活就业医保可能不设个人账户（如35岁以下不划入资金）。单位职工享受生育津贴等额外福利，个人需自行承担相关费用。 -
长期成本差异
退休后，单位参保者若缴满年限可终身免缴医保费并享受个人账户返款，而灵活就业者可能需继续缴费至规定年限，且部分地区退休后医保待遇较低。
总结：从总支出看，个人缴纳医保费用更高，但需结合收入水平、年龄及保障需求综合选择。若追求低成本且符合单位参保条件，优先选择职工医保；灵活就业者可通过提高缴费档次或补充商业保险增强保障。
