医保支付的发票是否可以在公司报销，需根据具体情况判断，主要分为以下几种情况：

一、员工个人医疗费用报销

1. 合规报销流程

   员工使用医保卡就医后，通过正规医疗机构取得合规发票，可将发票提交至公司财务部门报销。部分单位会将报销金额计入员工福利费，在税前扣除。

2. 注意事项

   • 报销需符合医保政策，如门诊、住院等费用均需在医保定点医疗机构开具有效发票；

   • 若员工个人负担部分（如自费项目）与医保报销部分需分别处理，自费部分不可报销。

二、企业职工集体福利费用报销

1. 体检费用报销

   企业为员工组织体检时产生的费用，若属于职工卫生保健范畴，可凭正规医疗机构的发票在税前扣除。但需注意，医保个人自付部分不参与报销。

2. 其他福利性质费用

   包括因公外地就医费用、未实行医疗统筹企业的职工医疗费用等，均属于职工福利费范围，可按规定报销。

三、禁止报销的情形

1. 个人自费项目

   员工个人承担的医疗费用（如丙类药品、自费检查等）及药店非正规发票，均不得报销。

2. 违规操作

   若发票来源不合法（如伪造、篡改）或用于非指定用途（如私人消费），不仅无法报销，还可能涉及法律风险。

四、报销限额与申报要求

• 企业需在年度企业所得税前据实扣除职工福利费，但不得超过工资薪金总额的14%；

• 报销时需提供完整发票、费用明细及真实性证明，确保符合《国家税务总局关于企业工资薪金及职工福利费扣除问题的通知》等法规要求。

医保发票能否报销需结合费用性质、发票合规性及企业财务政策综合判断。建议企业在操作前咨询当地税务机关或专业机构，确保符合最新政策规定。