昆山医保在南京可以使用，但需要提前办理异地就医备案手续。

异地就医备案的好处

1. 直接结算：在异地就医时可以直接使用医保卡结算，无需先垫付再回参保地报销，方便快捷。
2. 报销比例：异地就医备案后，医保的报销比例与参保地一致，不会减少报销比例。

异地就医备案的人员类型

1. 异地安置退休人员：退休后在异地定居且户籍迁入定居地的人员。
2. 异地长期居住人员：在异地居住生活且符合参保地规定的人员。
3. 常驻异地工作人员：用人单位派驻异地工作且符合参保地规定的人员。
4. 异地转诊人员：因患有限于本市医疗技术和设备条件不能诊治的疑难重症疾病，经具有转诊资质的市、县级以上医院诊断需要转往外地医院治疗的人员。
5. 其他临时外出就医人员：未按参保地规定办理转诊手续的其他临时异地就医人员。

异地就医备案的流程

1. 下载并注册“江苏医保云”APP，或使用其他指定的医保服务平台。
2. 阅读备案告知书，并填写备案信息和联系人信息。
3. 上传相应的备案证明材料，如户口本、房产证、居住证等。
4. 查询备案状态，备案成功后即可在备案的就医地使用医保卡直接结算。

异地就医备案的注意事项

1. 备案有效期：备案手续有效期通常为一年，具体以当地政策为准。
2. 报销比例差异：异地就医直接结算可能存在费用待遇差异，属于正常现象。
3. 医保电子凭证：尚未激活医保电子凭证的参保人员需要先行激活后，再申请办理医保业务。
4. 先入院后备案：如已住院，备案开始时间应为入院时间，否则备案无效。

常见问题与处理办法

1. 备案审核进度查询：可在“江苏医保云APP”中查询异地就医备案审核进度。
2. 异地划卡报错：如出现就医故障，不能刷卡结算，请先拍照保存报错图片后反馈参保地、就医地医保经办机构。
3. 异地联网医药机构查询：可登录“国家医保服务平台”或“江苏省医疗保障局官网”查询。
4. 医保经办机构联系方式：可拨打各地医保服务热线或登录“国家医保服务平台”查询。

通过以上步骤和注意事项，昆山医保参保人员可以在南京顺利使用医保卡就医，享受相应的医保待遇。