根据您描述的情况，医保缴费一年后余额仅1000多元，可能由以下原因导致：

一、医保类型差异

1. 城乡居民医保

   若您参加的是城乡居民医保，该险种通常无个人账户，所有缴费均进入统筹账户，个人无法直接查看账户余额。

2. 职工医保个人账户特点

   • 若为职工医保，个人账户有固定划入金额（如每月约30-50元），但总余额受缴费基数和单位缴费比例影响。若缴费基数较低或单位缴费不足，个人账户累计金额可能较少。

二、缴费基数与比例影响

• 缴费基数较低 ：个人账户划入金额与缴费基数直接相关。例如，月平均工资3000元时，个人账户每月仅划入60元（按2%比例计算）。

• 地区政策差异 ：不同地区对职工医保个人账户的划入标准不同，部分地区可能因财政补贴较少导致账户金额较低。

三、其他可能原因

1. 缴费记录异常

   若存在断缴、漏缴或重复缴费等情况，可能导致账户金额计算错误，建议通过社保局查询缴费明细。

2. 账户类型误解

   部分灵活就业人员可能误将统筹账户与个人账户混淆，实际只能看到个人账户的300-500元余额（总缴费额的60%-70%进入统筹）。

建议处理方式

1. 核对账户类型

   确认是否为职工医保及缴费基数是否正确，可通过社保局APP或线下渠道查询账户明细。

2. 咨询医保部门

   若对缴费金额或账户余额有疑问，建议联系当地医保部门核实政策或申请补缴。

3. 关注年度清零机制

   若属于职工医保，需注意个人账户年度清零规则，未使用的金额不会结转至下一年度。

若经核查发现单位缴费漏缴，可要求单位补缴；若涉及权益受损，可向社保部门投诉或通过法律途径维权。