特殊病种门诊涵盖的疾病范围广泛，主要包括需长期治疗、费用较高的慢性病和重症，例如器官移植抗排异治疗、糖尿病并发症、高血压合并症、精神类疾病等。各地医保政策对病种分类略有差异，但普遍分为一类（重症/高费用病种）和二类（慢性病/需持续管理病种），部分病种可享受门诊报销比例提升或额度倾斜待遇。
一类病种通常包括恶性肿瘤、尿毒症透析、器官移植术后抗排异治疗、血友病、再生障碍性贫血等，这类疾病治疗周期长、费用高昂，医保报销比例较高。二类病种覆盖更广泛的慢性病，如糖尿病（伴并发症）、高血压（2级以上伴器官损害）、冠心病、肝硬化、帕金森病、系统性红斑狼疮等，部分地区还将精神分裂症、癫痫、阿尔茨海默病等纳入保障范围。儿童特定疾病如先天性心脏病、地中海贫血、苯丙酮尿症等常被单独列出，享受专项待遇。
办理流程上，参保人需持二级以上医院诊断证明向医保部门申请备案，部分城市已实现线上无感备案。需注意，同一患者通常限申报一种特殊病种，但多地正逐步优化政策，允许合并病种认定。异地就医时需提前确认备案规则，部分病种可能限制定点机构数量。
建议参保地最新医保目录调整，部分新增病种（如耐药结核病、普拉德-威利综合征等）可能未被广泛知晓。及时备案可显著减轻门诊治疗负担，尤其对需要持续用药或康复管理的慢性病患者至关重要。
