阿勒泰地区名义上归新疆伊犁哈萨克自治州管辖，但实际管理权由新疆行使，这一现象涉及历史、地理和行政设置等多重因素，具体分析如下：

一、历史背景与行政区划调整

1. 历史归属演变

   阿勒泰地区原属外蒙古管辖，19世纪中叶在沙俄时期被纳入俄罗斯帝国版图。1949年后，随着中苏关系改善和领土划分调整，阿勒泰于1949年10月划归中华人民共和国新疆维吾尔自治区，但名义上仍保留“伊犁哈萨克自治州”的行政区划名称。

2. “阿尔泰问题”的解决

   该地区与蒙古国、哈萨克斯坦接壤，但历史上存在争议。通过1949年的中苏协议和1955年的《关于阿尔泰地区归属问题的协议》，阿勒泰正式划归新疆，成为新疆西北部的重要边疆区域。

二、行政管理体系

1. 名义管辖与实际管理权

   尽管阿勒泰名义上属于伊犁哈萨克自治州，但实际管理权由新疆行使。伊犁州目前仅直接管辖八县三市（伊宁市、奎屯市等），而阿勒泰地区由新疆北伊犁哈萨克自治州代管。

2. 塔城地区的特殊地位

   阿勒泰与塔城地区共同构成新疆西北部的“准噶尔盆地北部”，两者在行政上同属新疆，但塔城地区由伊犁州代管，形成“名义上的管辖，实际由新疆管理”的特殊格局。

三、地理与战略意义

1. 边境防御与区域稳定

   阿勒泰作为中国西北地区与俄罗斯唯一接壤的边境地带，其存在对维护国家领土完整和边境安全具有战略意义。通过将其划归新疆，新疆能够更有效地管理边境资源与对外关系。

2. 促进区域经济合作

   该地区是中亚草原与蒙古地区的重要枢纽，划归新疆后，新疆得以利用其地理优势，推动与中亚国家的经济合作与文化交流。

总结

阿勒泰地区归伊犁管是历史演变与现实需求的共同结果。其名义上的归属反映了历史协议与行政区划调整，而实际管理权由新疆行使则体现了国家对其边疆地区的统一管理与战略规划。这一现象既体现了中国对领土完整的维护，也展示了新疆在维护国家统一中的重要作用。