关于职工医保停缴后如何缴纳农村医保的问题，根据相关政策和流程，可分为以下几种情况处理：

一、转为新型农村合作医疗保险（新农合）

1. 办理职工医保停保手续

   需联系单位人力资源部门或当地社保经办机构办理停保手续，确认停保生效时间。

2. 准备材料并办理新农合参保登记

   携带身份证、户口簿、近期免冠照片等材料，前往户籍所在地村委会或乡镇政府办理参保登记。

3. 缴费与待遇享受

   • 新农合通常每年集中缴费，需在当年缴费期内完成，次年才能享受待遇。

   • 若断缴超过3个月，再次参保需等待3-12个月（每多断缴1年增加1个月）才能报销。

二、以灵活就业人员身份参保

1. 确认参保条件

   若职工医保停缴后未重新就业，可咨询当地社保部门是否允许以灵活就业人员身份参保。

2. 缴纳费用

   按照当地灵活就业人员社保缴费标准，向社保经办机构缴纳医疗保险费用。

3. 待遇享受

   灵活就业人员社保与职工医保待遇不同，通常为门诊报销，且缴费基数和比例较低。

三、注意事项

1. 避免重复参保

   职工医保与农村医保不可同时缴纳，需根据自身情况选择其中一种。

   若已参加新农合但未缴费，次年将自动失效，需重新参保。

2. 处理特殊情况

   • 离职人员需在离职证明有效期内办理职工医保停保和新农合参保。

   • 若单位在外地，需先在原参保地办理职工医保减员手续，再回户籍地办理新农合参保。

3. 政策咨询

   具体操作流程可能因地区政策差异较大，建议提前电话咨询当地社保部门（如12333）或社保经办机构。

通过以上方式，职工医保停缴后可根据实际情况选择继续参保新农合或转为灵活就业社保，确保医疗保障不中断。