当入库单和发票金额不一致时，需根据具体情况进行合理处理，主要分为以下几种情况：

一、发票金额大于入库单金额

1. 合理损耗情况

   若差异由运输途中的合理损耗导致，可按发票金额入账，将损耗数量单独记录在入库单中，并通过“待处理财产损溢”科目核算。

2. 发票错误处理

   • 若发票金额错误，需联系供应商重新开具正确发票，按新发票金额调整账目。

二、发票金额小于入库单金额

1. 未付款项调整

   若购买方未付清款项，按实际收款金额入账，差额暂挂为“应收账款”。

2. 费用扣除处理

   若差异因购买方代扣费用（如运输费、税费），需将费用计入“销售费用”，差额调整“应收账款”。

三、数量差异处理

• 合理损耗 ：按发票单价重新计算入库数量，调整入库单和发票金额。

• 不合理损耗 ：需查明原因，若属于管理不善，应计入“营业外支出”。

四、其他注意事项

1. 单据审核 ：入库前需核对采购合同、发票、入库单等原始凭证，确保信息一致。

2. 税务合规 ：发票金额与入库金额的差异可能影响增值税申报，需确保符合税法规定。

3. 系统调整 ：使用ERP或财务系统时，可通过调整单据或创建红字发票进行修正。

示例账务处理

场景 ：发票金额1000元，入库单金额1050元（合理损耗5%）

处理 ：按发票金额1000元入账，单独记录损耗数量，库存商品增加1000元，待实际入库时再调整。

通过以上方法，可确保账目准确反映实际业务情况，同时符合财务规范。若差异持续存在，建议定期进行内部审计。