根据我国现行社保政策，职工医保和合作医疗（包括新农合）是两种不同的医疗保障体系，存在以下核心区别：

一、参保对象与缴费标准

1. 职工医保

   由用人单位和职工共同缴纳，覆盖城镇职工及灵活就业人员，属于强制参保项目。

   • 职工个人缴费比例约为2%-3%，单位缴费比例6%-10%。

2. 合作医疗（新农合/城乡居民医保）

   主要覆盖农村村民及未参加职工医保的城乡居民，属于自愿参保项目。

   • 由个人缴费（通常为每年几百元）和政府补贴组成，缴费标准低于职工医保。

二、待遇享受原则

• 社保与合作的“二选一”性

  职工医保和合作医疗是两种独立的医疗保障体系， 不能同时参保 。已参加职工医保的职工无需再缴纳合作医疗费用，反之亦然。

• 重复参保的处理

  若职工同时缴纳了职工医保和合作医疗，需主动申请终止其中一种。若未主动处理，可能导致重复缴费或影响待遇享受。

三、法律依据与政策依据

• 《社会保险法》第二十三条

  明确规定职工应当参加职工基本医疗保险，未参加的不得享受职工医保待遇。

• 政策统一性

  国家通过社保制度实现医疗保障的公平性，职工医保作为基本医疗保障体系，已覆盖城镇职工，无需再通过合作医疗实现医疗保障。

四、特殊情况说明

• 灵活就业人员

  若为灵活就业人员且未参加职工医保，可根据自身经济状况选择参加职工医保或城乡居民医保，但需承担全部缴费责任。

职工医保与合作医疗不可同时参保，已参加职工医保的职工无需再缴纳合作医疗费用。若存在疑问，建议咨询当地社保部门确认。