小颌畸形综合征是一种较为复杂的先天性疾病，患者会经历多方面的不适感，主要包括以下几个方面：

1. 呼吸障碍：由于下颌骨发育不全和腭裂，舌根后坠，造成上呼吸道梗阻，患儿会出现吸气性呼吸困难、气促、阵发性青紫及窒息等症状。在仰卧位时症状可能加重，而在清醒或哭泣时，气道基本通畅，呼吸受阻多无声嘶，其喘鸣声与喉源性不同。

2. 喂养困难：患儿因口腔结构异常，难以正常吸吮和吞咽，导致进食困难，易呛咳，进而引发营养不良、体重不增、生长缓慢等问题。

3. 睡眠不安：睡眠时可能会因为呼吸不畅而出现睡眠不安、张口呼吸、打鼾等情况，长期如此会影响睡眠质量，进而影响患儿的生长发育和身体健康。

4. 耳部问题：腭裂的存在会使食物易呛入气管与耳咽管，容易并发中耳炎，导致耳部疼痛、听力下降等不适。

5. 心血管问题：约20%的病例伴心血管畸形，如动脉导管未闭、房间隔缺损、主动脉缩窄、右位心等，可因上呼吸道梗阻而致肺动脉高压和肺心病。

6. 其他不适：还可能伴有眼缺陷、骨骼畸形、耳郭畸形、中耳内耳结构异常引起的耳聋、增殖体肥大、先天性心脏病与智力低下等。

总的来说，小颌畸形综合征会给患者带来诸多不适，严重影响患者的生活质量和身体健康。一旦确诊，应尽早进行综合治疗，以缓解症状，提高患者的生活质量。