甲状腺功能异常伴发的精神障碍病因复杂，涉及多种因素。甲状腺激素水平的变化直接影响大脑的功能和代谢过程，这可能是导致精神障碍的关键原因。甲状腺功能亢进（甲亢）和甲状腺功能减退（甲减）都会引发一系列精神症状。
对于甲亢而言，其精神障碍的发生可能与内分泌紊乱有关，特别是由于甲状腺素分泌过多引起的身体代谢加快，能量消耗增加。这种情况可能导致患者出现情绪激动、易怒、失眠、焦虑等症状。有理论认为甲亢时的β肾上腺素受体敏感性增加以及甲状腺产生的毒性物质都可能参与了精神障碍的发生。心理因素如长期的精神紧张、抑郁等负面压力也可能成为甲亢发病的诱因。性格特征同样在甲亢的精神障碍中扮演重要角色，研究表明甲亢患者通常表现出内向、不稳定的情绪特征。
另一方面，甲状腺功能减退（甲减）伴发的精神障碍主要是由于甲状腺素合成、分泌减少或生物效应缺陷引起的脑代谢改变所致。当体内甲状腺激素不足时，会导致全身代谢率降低，进而影响到中枢神经系统的正常功能。这种情况下，患者可能会经历记忆力减退、注意力不集中、反应迟钝等认知功能下降的现象。甲减还可能导致心血管系统的问题，进一步加剧精神状态的恶化。
除了上述直接由甲状腺激素变化引起的生理机制外，遗传因素也在甲状腺功能异常伴发的精神障碍中起到重要作用。例如，在甲亢患者中发现存在促甲状腺激素受体自身抗体，表明该病具有一定的遗传倾向。而对于甲减，遗传缺陷被认为是造成甲状腺素合成酶系统功能障碍的原因之一。
环境因素也不可忽视，比如抗甲状腺药物的使用、甲状腺手术、放射性碘治疗等因素均可能导致甲状腺功能减退。慢性疾病的压力、生活中的重大事件等也可能是诱发甲状腺功能异常及相应精神障碍的重要外部因素。
甲状腺功能异常伴发的精神障碍是由多方面因素共同作用的结果，包括但不限于内分泌失调、遗传背景、个体的心理特质以及外界环境的影响。针对这些病因的理解有助于制定更加有效的预防和治疗方法。
