对于治疗尿中有蛋白（蛋白尿）的医院选择，建议您考虑以下几点：

1. 医院资质和专业水平：选择一家具有良好资质和专业水平的医院是确保治疗效果的关键。您可以了解医院的泌尿科或肾内科的专业水平，以及是否有专门的蛋白尿治疗团队。

2. 医生经验和口碑：选择一位有丰富经验和良好口碑的医生也非常重要。您可以了解医生的专业背景、学术成就以及患者的评价。

3. 医院设备和技术：先进的医疗设备和技术可以提高诊断和治疗的准确性和效果。您可以了解医院是否拥有先进的检查设备（如尿液分析仪、肾活检设备等）以及治疗技术（如药物治疗、血液净化等）。

4. 医院环境和服务：良好的医院环境和服务可以提高患者的就医体验和满意度。您可以了解医院的就诊流程、医护人员的态度以及患者的反馈。

在内蒙古呼伦贝尔地区，以下几家医院可能符合上述要求：

1. 呼伦贝尔市人民医院：作为呼伦贝尔地区的综合性医院，该院拥有泌尿科和肾内科等相关科室，可能具备治疗蛋白尿的专业水平和设备。

2. 呼伦贝尔市中蒙医院：该院结合了中西医的优势，可能在蛋白尿的治疗方面有独特的方法和经验。

3. 呼伦贝尔市第二人民医院：作为一家专科医院，该院可能在特定疾病（如肾脏疾病）的治疗方面有更专业的团队和设备。

请注意，以上只是一些可能的选择，最终的医院选择应根据您的具体情况和需求来决定。建议您在做出决定之前，与医生进行详细的咨询和评估。