小儿衣原体肺炎是否会影响入职的问题可以从多个角度来探讨，包括疾病的传染性、治疗情况以及入职体检的标准等。

衣原体肺炎是一种由衣原体引起的肺部感染，它可以影响不同年龄段的人群，但在儿童中较为常见。根据相关资料，沙眼衣原体和肺炎衣原体是两种常见的引起小儿衣原体肺炎的病原体，它们分别通过母婴传播和人与人之间的呼吸道飞沫传播。因此，在患病期间，特别是如果患者表现出明显的症状如咳嗽或发热，那么这种疾病可能会有一定的传染风险。

关于治疗方面，小儿衣原体肺炎通常采用大环内酯类抗生素进行治疗，疗程一般不少于2到3周，以防止病情复发。一旦患儿接受了适当的治疗并且病情得到了有效的控制，理论上来说，他们的健康状况不应该成为日后求职时的障碍。

当涉及到入职体检时，情况就变得复杂了。入职体检的目的之一是为了确保新员工的身体状况适合从事特定的工作，并且不会在工作环境中造成传染病的传播。虽然一般的肺炎在经过适当治疗后不会对入职产生影响，但如果是在急性期，尤其是具有传染性的阶段，那么这可能会影响到入职的结果。某些职业对于员工的健康状况有着特别严格的要求，例如医疗行业或者食品加工行业，这些行业可能会更加关注潜在员工是否存在任何可能导致传染病传播的风险因素。

具体到小儿衣原体肺炎的情况，如果一个人曾经患有此病但已经痊愈，那么这通常不会对未来的就业机会构成威胁。但是，如果正处于患病状态，尤其是在有明显症状的情况下，可能需要先完成治疗并提供医生出具的康复证明才能顺利入职。这是因为，尽管小儿衣原体肺炎不像一些其他类型的肺炎那样严重，但它仍然有可能通过呼吸道分泌物传播给他人。

小儿衣原体肺炎本身并不必然阻碍个人未来的职业发展，关键在于疾病的当前状态（即是否处于活动期）、治疗效果以及所申请职位的具体健康要求。如果有任何疑问，最好提前咨询招聘单位的人力资源部门了解具体的入职体检政策和标准。同时，遵循医生的指导完成全程治疗也是确保不影响未来职业生涯的重要步骤。

请注意，以上信息仅供参考，具体情况应结合最新的医学建议和个人实际情况考虑。如果你正在处理此类问题，建议直接向专业医疗机构寻求帮助。