绍兴农保参保人员在杭州就医是可以报销的，但具体报销流程和比例会根据不同的情况有所不同。以下是对这一问题的详细解析：

根据我国现行的医保政策，社会保险行政部门和卫生行政部门已经建立了异地就医医疗费用结算制度，这意味着农村合作医疗的参保人员在异地也可以享受基本医疗保险待遇 。因此，绍兴农保的参保人在杭州就医时，只要符合相关规定，就可以申请报销。

具体到绍兴农保在杭州的使用，如果是在杭州的跨省定点医疗机构住院治疗，出院时可以直接刷卡结算报销，这被称为“一站式结算”。但是，在进行这种直接结算之前，通常需要先完成一些必要的步骤，如通过电话联系绍兴当地的医保经办机构申请办理跨省就医转诊手续，并选择符合条件的定点医疗机构进行就医 。

对于具体的报销比例，它会依据绍兴市和杭州市的医保政策以及所就诊医院的级别来确定。例如，如果是乡镇卫生院，起付线为100元，报销比例为90%；县级定点医院起付线为200元，报销比例为82%；市级定点医院起付线为500元，报销比例为65%；省级定点医院起付线为700元，报销比例为55%；而省外非定点医院就医，起付线则提高到了1000元，报销比例降为45% 。值得注意的是，这些数据可能会随时间变化而有所调整，因此建议在实际操作前咨询最新的政策规定。

如果因为系统故障等问题无法在医院进行即时报销，患者还可以携带住院医疗费用清单、住院医疗费用发票、住院小结等资料前往医保服务中心大厅办理报销手续 。同样地，若未事先办理异地就医备案，则需要自行垫付全部医疗费用后，再凭相关材料回到绍兴市的医疗保险机构申请报销 。

最后，值得注意的是，尽管医保同城互认已在浙江省内实施，即全省11个设区市的医保参保人员可以在市本级定点医药机构实现互认并刷卡结算 ，但对于绍兴农保卡是否能在杭州所有医院通用还需进一步确认，因为不同地区的医保政策和管理机构可能存在差异 。因此，在计划前往杭州就医前，最好提前向当地医保管理部门或目标医院咨询确认相关信息，确保能够顺利使用绍兴农保卡进行报销。

绍兴农保在杭州是能够报销的，但为了确保报销过程顺利无误，参保人应遵循正确的流程，包括但不限于办理必要的转诊手续、选择合适的定点医疗机构以及准备好所需的报销材料等。同时，考虑到政策可能存在的变动性，及时获取最新信息也是非常重要的。