医疗机构依法执业自查内容主要包括以下方面，综合多个权威文件整理如下：

一、医疗机构资质与执业管理

1. 《医疗机构执业许可证》是否合法有效，是否存在超范围执业行为；

2. 医疗机构名称、诊疗科目、登记机关、法定代表人等是否与《执业许可证》一致；

3. 机构是否定期进行执业许可延续注册或变更登记。

二、医务人员资质与执业管理

1. 在岗医务人员是否均取得《执业医师资格证书》或《护士执业证书》；

2. 医务人员是否在注册范围内执业，是否存在无证行医或违规使用执业证书；

3. 医务人员是否定期进行继续医学教育和培训。

三、药品与医疗器械管理

1. 药品和医疗器械是否通过正规渠道采购，是否存在假药、劣药；

2. 医疗器械是否定期进行维护、消毒和质量检测，是否建立使用档案；

3. 临床用血、精麻药品等特殊药品是否按规范管理。

四、医疗服务质量与安全

1. 医疗质量管理体系是否健全，是否定期开展医疗质量评估；

2. 医疗安全管理制度是否完善，是否建立医疗事故应急预案；

3. 医疗服务是否规范，是否存在乱收费、过度医疗等行为。

五、医疗文书与档案管理

1. 病历、处方等医疗文书是否真实、规范，是否及时归档；

2. 医疗机构是否建立电子病历系统，实现信息共享；

3. 重大医疗决策是否履行告知同意程序。

六、传染病防治与公共卫生管理

1. 是否建立传染病防治责任制，是否及时报告传染病疫情；

2. 医疗机构是否开展传染病防控知识培训及宣传；

3. 医疗废物、放射性物质等危险废物是否按规范管理。

七、其他专项管理

1. 医疗保险服务是否合规，是否存在拒付、拒赔行为；

2. 医疗机构是否开展母婴保健、计划生育技术服务等专项管理；

3. 放射诊疗、职业健康检查等特殊服务是否依法依规。

八、自查频率与整改机制

1. 每年是否至少开展一次全面自查，专项自查是否及时响应风险隐患；

2. 日常自查是否每季度至少开展一次，是否建立问题整改台账；

3. 是否建立内部监督机制，对发现的问题是否及时整改并报告。

以上内容需结合医疗机构实际情况制定具体自查方案，确保自查工作全面、深入。自查报告应包括自查范围、方法、结果及整改措施，并报卫生健康行政部门备案。