缴费指数低于0.6的原因主要有以下几点：

1. 社平工资统计口径的不一致 ：在实际操作中，由于各地对于社平工资的统计口径并非完全统一，可能导致缴费指数的计算结果出现偏差。例如，如果分子的缴费指数是以地市级工资水平核算的，而分母的社平工资却是以省级的社平工资进行核算，这就很可能导致最终得出的缴费指数小于0.6。

2. 部分地区最低缴费档次低于60% ：部分地区的社保政策存在一些特殊情况，例如，四川、北京等地曾经允许灵活就业人员和困难企业按照低于60%的档次进行缴费，如40%的档次。这种情况下，参保人员的缴费指数也会相应降低。

3. 养老金迁移、补缴和合并的影响 ：养老金的迁移、补缴和合并也可能对缴费指数产生影响。例如，拆迁、征地或者外省社保合并等涉及补缴的情况时，可能涉及不同时间、不同地区的缴费基数和社平工资，这就会在平均缴费指数的计算过程中引发一系列的变化。

4. 历史因素 ：早期，尤其是2000年以前，是没有最低档这种说法的，很多人在上世纪90年代的缴费，如果按照月平均缴费指数公式来计算的话，计算出来的月平均缴费指数都是低于0.6的。后来有了60%档次划分的时候，平均缴费指数才是0.6。

5. 政策允许 ：由于我国养老保险最初是由各地自行建立起来的，至今还没有实现全国统一，所以各个地方的政策千差万别，也经常会出现平均缴费指数低于0.6或者高于3的情况。例如，地方性允许按照低于60%基数缴费。

缴费指数低于0.6的原因可能是多方面的，包括社平工资统计口径的不一致、部分地区最低缴费档次低于60%、养老金迁移、补缴和合并的影响、历史因素以及政策允许等。这些因素共同作用，导致参保人员的平均缴费指数低于0.6。