根据复旦版《2023 年度中国医院综合排行榜》及相关信息，以下是南京排名较为靠前的十家三甲医院：
- 江苏省人民医院（南京医科大学第一附属医院）：在复旦全国综合榜中表现优异，是国家重大疫情救治基地、国家（江苏）紧急医学救援队承建单位，拥有国家重点学科 1 个，国家临床重点专科 19 个。
- 南京大学医学院附属鼓楼医院：始建于 1892 年，是中国最早的西医院之一，国家重点学科、国家临床重点专科 10 个，在干细胞临床研究、严重脊柱侧弯矫形等方面处于国际领先水平。
- 东部战区总医院：集医疗、教学、科研、保健于一体，整体医疗技术水平较高，在心肺脑复苏、肾小球疾病、小肠移植等方面成效显著。
- 东南大学附属中大医院：教育部直属的国家 “双一流” A 类、“985 工程”、“211 工程” 重点建设大学附属医院，拥有重症医学、肾脏病学等江苏省医学重点专科。
- 江苏省肿瘤医院：是江苏省唯一的省级肿瘤专科医院，在肿瘤学领域具有较高的声誉，位列 2023 年度复旦版中国医院专科声誉排行榜肿瘤学第 9 名。
- 南京医科大学附属口腔医院（江苏省口腔医院）：是江苏省第一所三级甲等口腔专科医院，牙体牙髓病科、口腔颌面外科、口腔修复科、口腔正畸科均为国家临床重点专科。
- 南京脑科医院：我国最早的国立脑医学专科医院，为国家精神区域医疗中心创建单位，精神科为首批国家临床重点专科，精神医学连续 12 年位居专科声誉和专科综合排行榜全国第 6 位。
- 江苏省中医院：全国首批成立的省级中医医院之一，首任院长叶橘泉为中科院学部委员，持续保持在全国中医系统的领先地位。
- 南京市第一医院：原卫生部首批三级甲等综合性医院，是国家高级卒中中心、国家药物临床试验机构、国家首批心脏移植准入医院、国家首批工伤康复试点机构。
- 南京市第二医院（南京市公共卫生医疗中心）：集医疗、教学、科研、预防为一体，以 “精专科、强综合、重防治、应突发” 为特色，感染性疾病科为国家级临床重点专科。
