根据搜索材料和相关分析，内蒙古医科大学附属医院和内蒙古自治区人民医院都是内蒙古自治区内非常优秀的医院，各有特点。以下是它们的一些比较：

内蒙古医科大学附属医院

1. 1.综合实力：内蒙古医科大学附属医院是内蒙古自治区最大的三级甲等综合医院，医疗水平高，设备先进。
2. 2.医疗服务：医院在多个临床科室和研究中心设有专业团队，能够提供全面的医疗服务。
3. 3.数字化建设：医院在数字化建设方面有较高的水平，部署了多台医疗自助终端，极大地改善了患者的就医体验。
4. 4.辅助生殖技术：生殖医学中心是自治区内首家获得资格认证的，开展的辅助生殖技术较为全面，包括AIH/人工授精、一代试管、二代试管、三代试管等

内蒙古自治区人民医院

1.综合实力：内蒙古自治区人民医院也是一家三级甲等综合医院，医疗技术先进，医护团队专业

2.医疗服务：医院在多个医疗领域都有出色的表现，特别是在内分泌、心脑血管等领域

3.辅助生殖技术：生殖医学中心于2010年通过原国家卫生部批准开展辅助生殖助孕技术，目前开展的技术包括宫腔内人工授精、体外授精-胚胎移植、卵胞浆内单精子显微注射、胚胎保存等

综合比较

1.辅助生殖技术：如果患者需要进行辅助生殖治疗，特别是三代试管，内蒙古医科大学附属医院可能是更好的选择，因为其生殖医学中心技术更为全面

2.综合医疗服务：两家医院在综合医疗服务方面都非常出色，选择哪家医院可以根据患者的具体需求和偏好来决定

3.患者体验：内蒙古医科大学附属医院在数字化建设和患者就医体验方面有较高的评价。

结论

总体而言，内蒙古医科大学附属医院和内蒙古自治区人民医院都是非常优秀的医院，选择哪家医院主要取决于患者的个人需求和具体情况。如果需要更全面的辅助生殖技术，内蒙古医科大学附属医院可能是更好的选择；如果更关注内分泌、心脑血管等领域的治疗，内蒙古自治区人民医院也是不错的选择。