印度未能完全占领墨脱的原因可以从历史、地理、军事和外交等多个角度来分析：

1. 历史背景：墨脱县是中国西藏自治区的一部分，尽管英国殖民者通过所谓的“麦克马洪线”试图将包括墨脱在内的大片中国领土划入印度版图，但中国政府从未承认这条非法边界线。在1962年的中印边境自卫反击战中，中国军队成功地控制了墨脱地区的大部分，并且此后一直保持对该地区的实际控制。

2. 地理位置：墨脱位于喜马拉雅山脉南麓，地形极其险峻，海拔落差大，交通不便，这使得任何大规模的军事行动都面临极大的挑战。对于印度而言，要完全占领并维持对这一区域的长期控制是非常困难的。

3. 军事防御：解放军在墨脱设有驻军，并且由于墨脱的战略位置，它成为了中国边防的重要据点。即使印度曾试图侵占该地区，但由于解放军的存在以及高地势带来的战术优势，印度难以实现全面占领。

4. 国际法与外交：虽然印度在部分地区建立了实际控制（即所谓的“阿鲁纳恰尔邦”，中国称其为藏南地区），但这些行为并未得到国际社会的普遍认可。中国始终坚决维护自身领土主权，并通过外交途径持续表达立场，这也限制了印度进一步扩大其实际控制范围的能力。

尽管印度占据了部分争议地区，但由于上述因素，它未能完全占领墨脱。中国继续主张对整个墨脱地区的主权，并通过军事部署及基础设施建设加强了对该地区的管理和控制。