农村合作医疗是否有二次补助，取决于具体的政策和实施情况。根据搜索材料和我的知识，以下是详细的解释：

1. 1.基本医疗保险报销后的二次报销：根据国家政策，农村合作医疗（简称“新农合”）的居民在基本医疗保险报销后，如果个人自付费用超过上一年度农村居民年人均纯收入的标准，可以申请大病保险的二次报销
2. 2.部分地区实施的二次报销政策：在一些地区，如南通市，政府实施了“乡村公益医疗互助”项目，这是一种类似于“第二个农保”的政策。这种互助项目允许符合条件的村民在农保或社保报销后，再次申请报销。具体报销条件和流程可能因地区而异，但通常需要满足一定的住院费用门槛，并且报销比例和上限也有所不同。
3. 3.具体报销流程和条件：报销条件：通常需要满足住院时间、住院费用门槛等条件。例如，南通市的政策要求单次住院个人支付金额达到一定数额才能申请报销。报销方法：一些地区提供手机APP进行报销申请，例如“乡村公益医疗互助”APP或“福村宝”APP。申请时需要提供出院记录、住院费用清单、农保或社保报销单等资料。报销比例和上限：报销比例和上限因地区和具体政策而异。例如，南通市的政策规定每人每年累计最高可报10万元。
4. 4.注意事项：二次报销通常需要参加当年的新农合，并且基金结余充足报销时需要提供相关材料，如身份证、参合证、费用清单、出院小结等部分特殊疾病患者可能享受更高的报销比例或更宽松的报销条件

农村合作医疗是否有二次补助取决于具体的政策和实施情况。在一些地区，政府实施了类似于“第二个农保”的互助项目，允许符合条件的村民在基本医疗保险报销后再次申请报销。建议您咨询当地卫生部门或村委会，了解具体的政策和操作流程。