生育津贴打到公司账户后，公司需要扣除的费用主要包括以下几项：

1. 社会保险费 ：单位需要为员工缴纳养老、医疗、失业、工伤和生育保险费用，这些费用会根据员工的工资标准和比例进行计算缴纳。

2. 个人所得税 ：生育津贴算作个人收入，单位需要根据国家规定为员工代扣个人所得税，并按照相关法规进行缴纳。

3. 其他个税 ：根据工作地点及当地政策，可能还需要缴纳城市维护建设税、教育费附加等个人所得税附加费用。

4. 其他福利扣款 ：例如公积金、住房公积金等福利扣款，根据当地政策和公司制定的规定，可能也需要从生育津贴中扣除。

需要注意的是，生育津贴的领取不需要扣除已经缴纳的社保和公积金，应全额发给员工。生育津贴的计算方式为用人单位上年度职工月平均工资除以30天，再乘以规定的假期天数。如果社保局按照单位申报的全员平均工资报销发放的金额高于职工实际工资，则差额归个人所有；如果报销金额低于职工实际工资，则用人单位需补齐差额后发给职工。

公司在收到生育津贴后，需要扣除上述费用，并将剩余部分发放给员工。如果生育津贴高于员工实际工资，公司需要将差额部分转付给员工；如果生育津贴低于员工实际工资，公司需要补齐差额后发给员工。