光明区和光明新区主要有以下区别：

• 性质不同：光明新区是功能区，是为了实现某种目标而设立的管理区，并非行政区，在很多事务上缺乏法律主体资格。光明区是行政区，由法定机关批准成立，设立了人大、政协等整套地方政府机关，在管理和推动辖区经济建设等方面有更大的自主权。
• 成立时间和背景不同：光明新区成立于 2007 年 8 月 19 日，当时是深圳市委、市政府为了推进区域发展，在宝安区设立的一个功能新区，管辖公明、光明 2 个办事处。光明区是 2018 年 9 月 19 日正式挂牌成立，是在光明新区的基础上，经国务院批准设立的市辖区。
• 管理权限不同：光明新区作为功能区，其管理权限相对有限，主要是在经济发展、城市建设和管理、社会事务管理等方面承担一定职责，很多决策需要遵循上级政府或相关部门的规定。光明区作为行政区，拥有完整的行政管理权限，能自主制定和实施经济、社会、文化等各方面的发展规划和政策，在财政、税收、土地等方面有更大的决定权。
• 经济发展定位和产业结构不同：光明新区在发展初期主要是致力于打造生态型高新技术产业新城，是广深科技创新走廊的重要节点。光明区在此基础上，进一步明确了以大湾区综合性国家科学中心先行启动区建设为总牵引，打造超高清视频显示、新材料、高端医疗器械、生物医药、智能传感器等战略性新兴产业集群，以及合成生物、脑科学与脑机工程等未来产业集群，加快建设原始创新策源地、科研经济先行地、创新人才集聚地。