深圳医保和东莞医保存在多方面的区别，具体如下：

1. 缴费基数与比例

   • 深圳医保：职工基本医疗保险一档的缴费基数为职工本人月工资收入，缴费比例为8%，其中用人单位缴交6%，个人缴交2%；二档的缴费基数同为职工本人月工资收入，缴费比例为0.5%+0.2%（用人单位0.3%，个人0.2%）。居民基本医疗保险则以本市上上年度城镇居民月可支配收入为基数，费率为1.8%，个人和财政按比例分担，成年居民个人缴0.7%，财政补助1.1%；少年儿童和大学生个人缴0.6%，财政补助1.2%。
   • 东莞医保：职工医保用人单位承担3.0%，个人承担0.5%。灵活就业人员本人工资由本人按月如实申报，退休员工达到法定退休年龄而未达规定缴费年限的，可选择一次性缴足年限或继续按月缴费，其缴费基数调整为办理一次性缴费时或继续按月缴费时的上上年度职工月平均工资。

2. 医保待遇

   • 普通门诊报销
     • 深圳医保：职工基本医保、居民基本医保普通门诊统筹支付比例与医疗机构级别挂钩，一级以下医疗机构、二级医院、三级医院分别为75%、65%、55%，退休人员、60周岁及以上居民相应提高5%。职工基本医保一档年度支付限额从本市上上年度在岗职工年平均工资的5%，提高至在职人员6%、退休人员7%，其中在二级以上医院、专科医院的支付限额提高至在职人员3%，退休人员3.5%；二档及居民医保年度支付限额为本市上上年度在岗职工年平均工资的1.5%，建立动态调整机制。
     • 东莞医保：门诊报销根据不同情况有所差异，如在社区卫生服务机构看普通门诊，医保范围内费用可报销70%，但有最高支付限额；在定点医院看门诊，也可按规定报销一定比例的费用。
   • 住院报销
     • 深圳医保：市内一级以下医院、二级医院、三级医院首次住院起付线调整为200元、400元、600元，年度内二次及以上住院起付线为100元、200元、300元。职工基本医保一档参保人在一级以下医院、二级医院、三级医院住院支付比例分别为94%、92%、90%；二档及居民医保参保人支付比例分别为92%、91%、90%。退休人员、年满60周岁及以上的人员住院支付比例为95%。
     • 东莞医保：职工医保住院报销起付线一般为上年度全市职工年平均工资的10%，不同级别的医院报销比例有所不同，基本医疗在一级医院报销比例可达95%左右，在三级医院也能达到较高比例。年度最高支付限额与连续参保时间有关，连续参保时间越长，年度支付限额越高。
   • 大病保险
     • 深圳医保：职工基本医保、居民基本医保参保人均可按规定享受大病保险待遇。大病保险对住院及门诊特定病种等基本医疗费用中的个人自付合规高额费用进行“二次支付”，起付线为1万元，支付比例分段设定，1万元以上3万元以下为70%，3万元及以上部分为80%。大病保险年度支付限额与连续参加基本医疗保险的时间挂钩，连续参保时间满72个月以上的，年度支付限额为100万元。
     • 东莞医保：重大疾病医疗保险与基本医疗保险捆绑，无需额外缴费，住院花费超过一定额度才生效，额外报销部分。

3. 医保个人账户

   • 深圳医保：职工参加职工基本医疗保险一档的才有个人账户，其“个人账户”由本人缴费的2%计入，主要用于支付本人及其配偶、父母、子女符合国家、广东省及本市规定的费用。
   • 东莞医保：有医保个账，类似公积金，专门一笔钱，可以花在看病、药店买药、买政府合作保险（例如“莞家福”）。

4. 异地就医政策

   • 深圳医保：门诊和住院都可按规定享受异地就医待遇。长期异地就医备案或市外转诊情形下，市内外支付比例一致；异地急诊抢救和其他临时外出就医情形下，分别按照市内标准的90%和80%支付。且市内、市外就医医保统筹基金年度最高支付限额合并计算。
   • 东莞医保：异地就医需办理相关备案手续，未办理备案直接到外地就医的，报销比例会降低。

深圳医保和东莞医保在缴费基数与比例以及医保待遇等方面均存在显著差异。这些差异反映了两地医保政策的地域特色和发展水平，也为参保人提供了多样化的选择。