大病二次报销比例远低于预期，仅报了2%，可能有以下原因：

1. 未达起付线：各地大病二次报销设有起付线，如个人年度累计负担的合规医疗费用未超过此线，即便申请也无法报销。比如某地规定起付线为1.5万元，患者自付费用仅1万元，就达不到报销条件。

2. 非合规费用多：医保有报销范围，只有目录内药品、治疗等费用可参与二次报销。若患者使用较多目录外药物或接受非医保指定医疗服务，自费部分无法报销，会影响最终报销比例。

3. 特殊人群限制：部分人员如退休人员、儿童等，其大病二次报销政策与普通成年人不同，报销比例和额度有别。像退休人员可能因无补充医疗保险，报销比例相对较低。

4. 异地就医问题：异地就医需办理备案手续，未备案直接就医，报销比例会降低，影响二次报销金额。

5. 医保政策差异：不同地区经济发展水平和医保政策不同，报销比例和额度有差别。经济欠发达地区财政支持有限，居民医保二次报销比例可能较低；而经济发达地区政策相对较好，但也存在对特定疾病或治疗方式限制，导致部分患者报销比例低。

6. 申请流程及材料问题：申请二次报销需准备大量材料，如病历、诊断证明、发票等，缺任何一项都可能被退回重审，延误时间甚至导致无法报销。部分地区医保部门审核严格，存在过度医疗或不规范操作时，可能拒绝报销或降低报销比例。

大病二次报销比例低可能由多种因素导致，患者需了解当地政策，确保就医过程合规，以保障自身权益。