低保户缴纳的医保费用能否退还，需根据具体情况判断，主要分为以下几种情况：

一、可退还的情形

1. 重复参保情况

   若低保户在参加新型农村合作医疗（新农合）后，又通过其他途径（如单位缴费）参加了相同险种，导致重复参保，则可申请退还重复部分的费用。需提供低保证明、身份证及医保缴费凭证，按医保部门规定计算退还金额。

2. 户籍注销或参保人死亡

   若低保户户籍注销或本人去世，其缴纳的医保费用可申请退还。需提供户籍注销证明或死亡证明，向社保机构提交申请。

3. 其他特殊情况

   如参保人移民、参保人丧失劳动能力等，可依据相关法律法规申请退保退款。

二、不可退还的情形

1. 正常参保且未享受待遇

   低保户正常缴纳医保且未发生医疗费用等权益享受行为时，所缴费用通常无法退还。

2. 灵活就业人员缴费部分（城镇职工医保）

   若以灵活就业身份缴纳的医保属于个人缴费部分（如城乡居民医保），因政策规定一般不支持退还。

三、操作建议

• 联系当地社保部门

  通过社保经办机构窗口或税务部门提交申请，提供完整证明材料（如低保证明、身份证、缴费凭证等）。

• 确认缴费类型

  明确所缴医保类型（如新农合/城乡居民医保），不同类型退保规则差异较大。

• 避免重复缴费

  参保前应咨询相关部门，避免因信息不对称导致重复参保。

四、注意事项

• 退款流程可能因地区政策不同存在差异，建议提前电话咨询当地社保中心。

• 若因单位缴费导致的重复参保，需提供单位缴费证明。

综上，低保户缴纳的医保费用能否退还，需结合具体缴费类型、是否存在重复参保等情形综合判断，建议通过正规渠道咨询当地社保部门获取准确信息。