关于药店不接受5元以下医保卡支付的问题，可能由以下原因导致：

一、药店资质与医保协议

1. 非医保定点药店

   若药店未与医保机构签订合作协议，或未达到定点资质要求，则无法使用医保卡结算。

2. 医保账户余额不足

   职工医保个人账户无余额时，无法用于支付门诊费用；城乡居民医保无个人账户，直接纳入统筹支付。

二、药品与医保目录

1. 药品不在医保目录内

   保健品、美容类、滋补类等8类药物自2020年7月起不再纳入医保报销范围，且医保个人账户不得用于此类公共卫生费用。

2. 药品价格低于医保支付标准

   部分药品的医保直接支付价低于零售价，药店刷卡结算会损失利润，因此可能拒绝低金额刷卡。

三、系统与操作问题

1. 刷卡系统不支持

   药店信息化水平不足，医保刷卡流程复杂且耗时，可能影响效率。

2. 手续费成本

   每笔交易需支付4角手续费，低金额交易可能覆盖手续费成本，导致药店不愿办理。

四、其他特殊情况

• 参保类型差异 ：城乡居民医保无个人账户，无法使用医保卡。

• 社保卡激活问题 ：社保卡未激活或属性不匹配（如省市级与县级不一致）。

建议解决方案

1. 确认药店资质 ：通过“国务院客户端”小程序查询附近医保定点药店。

2. 检查医保账户 ：确保职工医保个人账户有余额且处于激活状态。

3. 核对药品目录 ：确认所购药品在医保报销范围内。

4. 直接咨询 ：向药店工作人员说明具体情况，避免因信息误差导致无法刷卡。

若遇到不合理拒绝，可通过12345热线或医疗保障部门投诉。