根据相关法律规定和医保政策，交通事故双方私了后医保是否报销需根据具体情况判断，具体规则如下：

一、医保报销的基本原则

1. 医保不支付第三方责任

   医保主要用于保障因疾病或非因工导致的医疗费用，而交通事故属于意外伤害，不在医保报销范围内。

2. 自费承担自身责任部分

   若事故由一方全责且与自身过错无关，自身承担的医疗费用需自行承担，医保不予报销。

二、特殊情况下的医保使用

1. 第三人不支付或无法确定

   若事故中有明确第三方责任人，但责任人未支付或无法确定，医保基金可先行垫付自身应担部分费用，后续向第三人追偿。

2. 全责且无过错

   若事故由一方全责且与自身过错无关（如对方逃逸、逃逸致人死亡等），医保需全额报销。

三、注意事项

1. 私了与公了的区别

   私了后若与保险公司协商的赔偿金额超过合理范围或未留存证据，可能影响后续保险理赔。建议通过交警认定和保险公司定损后协商，保留维修发票、医疗费用清单等必要证据。

2. 避免重复报销

   若通过私了获得赔偿后，又通过医保报销，可能涉及骗取医保基金的风险，导致医疗费用无法报销。

3. 及时报案

   发生事故后应立即报警并通知保险公司，避免因证据不足影响理赔。

四、总结流程

1. 责任认定 ：通过交警部门或保险公司定损明确责任比例。

2. 协商赔偿 ：与对方协商赔偿金额，保留证据。

3. 医保申请 ：符合条件时向医保部门申请报销自身承担部分。

建议优先通过正规渠道处理事故，确保权益得到合法保障。