根据相关法律法规和搜索结果，无施工许可证的情况下提交城建档案资料存在以下限制和注意事项：
一、施工许可证与档案提交的关联性
- 两者由同一部门管理
施工许可证的发放与城建档案的验收由同一部门负责，但两者是不同管理环节。施工许可证是工程开工的必要条件，而档案验收是工程竣工后的管理行为。
- 施工许可证是开工前提
根据《建设工程施工许可管理办法》，未取得施工许可证的工程不得擅自开工。若工程未合法开工，则无法完成符合规范的建设过程，进而无法形成完整、合规的工程档案。
二、无证施工的档案提交限制
- 无法通过档案验收
由于无证施工可能涉及未办理用地、规划许可，或施工条件未达标等问题，工程档案无法满足验收标准，导致无法通过城建档案馆的验收。
- 档案内容不完整
即使强行提交，无证施工的档案可能缺少施工图设计文件、施工进度报告、质量检测报告等关键材料，导致档案不完整或无效。
三、补办施工许可证的必要性
- 合法开工的必要条件
补办施工许可证需满足《建设工程施工许可管理办法》的五项条件，包括用地批准、规划许可、施工条件具备、施工企业确定及技术资料审查合格。
- 档案归档的先决条件
只有取得施工许可证并完成合法施工后，才能按规范进行工程档案的收集、整理和移交。
四、特殊处理建议
- 已开工但未证的情况
若工程已实际开工但未取得施工许可证，建议尽快补办。可先暂停施工，完成所需手续后再恢复施工，并同步推进档案工作。
- 合同备案的可行性
根据相关规定，即使无施工许可证，建设单位仍可进行施工合同备案，但需提交符合要求的备案资料。备案通过后，建议尽快补证并完成施工。
总结
无施工许可证的工程无法提交合规的城建档案。建议尽快补办施工许可证，确保工程合法开工并完成全部建设程序，从而满足档案验收要求。
