截至2025年，北京有多家医院在睡眠呼吸暂停综合征的治疗方面具有较好的口碑和专业能力。以下是一些推荐的医院：

1. 北京协和医院 ：作为国内顶级综合医院，北京协和医院在睡眠呼吸暂停综合征的诊断和治疗方面拥有丰富的经验。其心理医学科在国内名列前茅，能够处理复杂的睡眠障碍合并症。

2. 中国人民解放军总医院（301医院） ：这是一家大型现代化综合性医院，拥有多个国家重点学科和重点实验室，其综合诊疗特色在睡眠呼吸暂停综合征的治疗方面具有优势。

3. 北京大学第一医院 ：北大医院距离中南海最近，是一所融医疗、教学、科研、预防为一体的大型综合性医院，其在睡眠障碍的诊疗技术方面国内领先。

4. 北京大学第六医院 ：作为精神专科医院，其精神心理科在全国独占鳌头，对睡眠障碍与精神心理疾病的关联研究深入透彻，拥有先进的多导睡眠监测设备。

5. 首都医科大学附属北京安定医院 ：在睡眠医学研究与临床实践方面成果显著，专注于各类精神疾病相关性失眠。

6. 首都医科大学附属北京朝阳医院 ：作为北京市政府举办的三级甲等综合医院，其呼吸内科在睡眠呼吸暂停综合征的诊断和治疗方面具有专业优势。

7. 北京大学第三医院 ：这是一家在多个领域具有专业优势的大型综合性医院，其呼吸睡眠监测室配备了先进的设备，能够检测呼吸睡眠暂停。

8. 北京医院 ：其呼吸内科是重点科室，擅长老年病、疑难病、罕见病，包括睡眠呼吸暂停综合征的诊断和治疗。

这些医院在睡眠呼吸暂停综合征的治疗方面都有各自的优势和特色，建议根据患者的具体病情和需求选择合适的医院进行治疗。