灵活就业人员是否需要补缴缴费基数的差额，取决于当地社保部门的规定以及个人的缴费情况 。以下是一些具体情况：
- 需要补缴的情况 ：
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如果灵活就业人员的缴费基数低于当地规定的最低标准，则需要补缴差额。例如，广东省社平工资为9167元，如果补缴则按照5500元为基数去缴费，否则会拖低退休时的个人平均缴费指数。
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2022年1-9月期间，灵活就业参保人员需要补缴基数差额，最低档每月缴费由685.82元调整为766.4元，需补差725.22元。
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2024年1至10月期间，以灵活就业人员身份缴纳基本养老保险费，且缴费基数低于月缴费基数下限标准4317元的人员，需要补缴差额。
- 补缴方式 ：
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灵活就业人员可以通过代收银行的柜台确认新的缴费基数，然后把差额补上。
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如果已经缴纳了基本养老保险，但缴费基数不够，也需要去代收银行的柜台确认新的缴费基数，并补缴差额。
- 注意事项 ：
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已经退休、社保关系转到外省或者不幸去世的人员，不需要补缴差额。
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如果要办理社保关系跨省转移或者退休，需要先去社保经办机构办理差额补缴核定，然后再缴费。
综上所述， 灵活就业人员是否需要补缴缴费基数的差额，需要根据当地社保部门的规定和个人缴费情况来判断 。建议灵活就业人员及时关注当地社保部门的通知，确认是否需要补缴差额，并按照规定的程序进行补缴。
