南京职工医保补缴的最新规定如下：

1. 中断时间不超过3个月（含） ：

• 视作连续参保，参保缴费年限连续累计计算，期间发生的医疗费用按规定享受职工医保待遇。

2. 中断缴费超过3个月 ：

• 自补缴到账次日起享受职工医保待遇，中断缴费期间的个人账户予以补划，但补缴期间发生的医疗费用医保统筹基金不予支付。

3. 灵活就业人员超过3个月未足额缴费 ：

• 设置2个月待遇享受等待期，待遇享受等待期满后按规定享受职工医保待遇，补缴期间发生的医疗费用医保统筹基金不予支付。

4. 参加南京市社会保险后中断缴费的灵活就业人员 ：

• 女性48周岁以上、55周岁以下；男性58周岁以上、60周岁以下，在南京实际缴纳失业保险费不满15年的，可申请补缴至15年。

5. 因用人单位原因导致的社保未缴纳 ：

• 用人单位应为职工办理补缴，并提供相关证明材料，如劳动合同、工资发放凭证等。

6. 个人以灵活就业人员身份参加社保 ：

• 中断缴费超过3个月的，再次缴费时会有等待期的规定，滞纳金的计算通常根据欠费时间和欠费金额来确定。

建议：

• 对于用人单位而言，应及时为职工办理补缴手续，以避免影响职工的医保待遇。

• 对于灵活就业人员，若中断缴费超过3个月，需等待2个月才能享受医保待遇，建议尽早补缴以避免更大的损失。