江西新农合在深圳住院的报销比例主要根据医疗机构的级别来确定。具体来说:
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乡镇卫生院 :起付线为100元,报销比例为90%。
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县级定点医院 :起付线为200元,报销比例为82%。
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市级定点医院 :起付线为500元,报销比例为65%。
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省级定点医院 :起付线为700元,报销比例为55%。
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省外非定点医院 :起付线为1000元,报销比例为45%。
因此,如果参保患者在深圳的乡镇卫生院住院,报销比例最高,可达到90%;在省级定点医院住院,报销比例最低,为55%。建议患者在住院前咨询当地的新农合经办机构或医院,以了解具体的报销政策和起付线等信息。