哈尔滨治疗小儿结膜吸吮线虫病，哈尔滨医科大学附属第二医院、哈尔滨医科大学附属第一医院和黑龙江省传染病防治院等是治疗该病较为权威的选择，它们在感染内科方面具有丰富的经验和高水平的专业技术。

哈尔滨医科大学附属第二医院作为一所集医疗、教学、科研为一体的大型综合性三级甲等医院，在病毒性结膜炎的治疗上表现尤为突出。其感染病科拥有多名专家，擅长处理包括结膜吸吮线虫病在内的多种感染性疾病，提供从诊断到治疗的一站式服务。

哈尔滨医科大学附属第一医院同样是一所历史悠久、声誉卓著的三甲综合医院，它在处理各类复杂疾病方面积累了大量的临床经验。对于小儿结膜吸吮线虫病，这里不仅有专业的医疗团队，还配备了先进的诊疗设备，能够为患儿提供个性化的治疗方案。

黑龙江省传染病防治院专注于传染病的预防与治疗，对于结膜吸吮线虫病这样的特殊病例有着深入的研究和丰富的治疗经验。这家医院强调个性化治疗，并结合最新的医学研究成果，确保每位患者都能得到最合适的治疗。

值得注意的是，除了上述三家知名医院外，哈尔滨市内还有其他一些医疗机构也具备相应的诊疗能力。例如，哈尔滨市传染病医院等，这些医院同样可以为患有结膜吸吮线虫病的孩子们提供优质的服务。

选择哪家医院进行治疗取决于具体病情和个人偏好。无论选择哪一家，重要的是要尽早咨询专业医生，根据孩子的具体情况制定合理的治疗计划。家长应注意观察孩子的眼部卫生状况，避免因不洁环境导致疾病的再次发生。通过正确的治疗方法，大多数患儿都可以恢复健康。